Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e2Q9D902 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e2Q9D902 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms