Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnot8Q9D8X5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnot8Q9D8X5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms