Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9D8Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9D8Q6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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