Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Jam3Q9D8B7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Jam3Q9D8B7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms