Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4bQ9D8B3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms