Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn22Q9D7U6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms