Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs6Q9D6W8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs6Q9D6W8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms