Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip1Q9D620 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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