Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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