Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms