Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ShpkQ9D5J6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms