Protein–RNA interactions for Protein: Q9D592

Tmbim7, RIKEN cDNA 4930511M11, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim7Q9D592 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmbim7Q9D592 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim7Q9D592 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms