Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Taf1dQ9D4V4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Taf1dQ9D4V4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Taf1dQ9D4V4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Taf1dQ9D4V4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Taf1dQ9D4V4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1dQ9D4V4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms