Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms