Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933402D24RikQ9D4D3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933402D24RikQ9D4D3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms