Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms