Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms