Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph14Q9D3W1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms