Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms