Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Katnal2Q9D3R6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Katnal2Q9D3R6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms