Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy3Q9D394 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms