Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp5Q9D387 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms