Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X9

Tmem50b, Transmembrane protein 50B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50bQ9D1X9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem50bQ9D1X9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms