Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms