Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Susd3Q9D176 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Susd3Q9D176 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms