Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hddc3Q9D114 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Hddc3Q9D114 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hddc3Q9D114 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hddc3Q9D114 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Hddc3Q9D114 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Hddc3Q9D114 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Hddc3Q9D114 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hddc3Q9D114 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms