Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms