Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms