Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpsap1Q9D0M1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms