Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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