Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms