Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl35Q9CZ49 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl35Q9CZ49 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl35Q9CZ49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms