Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms