Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bud23Q9CY21 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bud23Q9CY21 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms