Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW2

Mrps22, 28S ribosomal protein S22, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps22Q9CXW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps22Q9CXW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms