Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo5Q9CXP9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo5Q9CXP9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms