Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm5Q9CXE0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm5Q9CXE0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms