Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf1Q9CWX2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms