Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms