Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn3Q9CVD2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms