Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl3Q9CUS9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl3Q9CUS9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms