Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rhobtb3Q9CTN4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhobtb3Q9CTN4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms