Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5sQ9CRA7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms