Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms