Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms