Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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FanclQ9CR14 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanclQ9CR14 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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FanclQ9CR14 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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FanclQ9CR14 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms