Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms