Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms