Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms