Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpa3Q9CQ71 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms